Als Mitglied eines Berliner Universitätskonsortiums, das im Rahmen der deutschen Exzellenzstrategie mit der Freien Universität Berlin als Trägerinstitution ausgewählt wurde, bietet die Hertie School eine Doktorandenausbildung an, die sich mit den Herausforderungen des liberalen Modells der politischen und wirtschaftlichen Ordnung befasst (SCRIPTS "Contestations of the Liberal Script"). Die Berlin Graduate School for Global and Transregional Studies (BGTS) ist das Doktorandenprogramm von SCRIPTS.