Die Berlin University Alliance ist ein Exzellenzverbund, der vom Bundesministerium für Forschung, Technologie und Raumfahrt (BMFTR) und dem Land Berlin im Rahmen der Exzellenzstrategie von Bund und Ländern gefördert wird. Die vier Partner der Berlin Alliance – Freie Universität Berlin, Humboldt-Universität zu Berlin, Technische Universität Berlin und Charité – Universitätsmedizin Berlin – erhielten die Förderung mit ihrem Antrag „Crossing Boundaries toward an Integrated Research Environment”. Die Förderung begann am 1. November 2019.

In der ersten Förderlinie der neuen Runde des Forschungswettbewerbs erhielten die Berliner Partner am 22. Mai 2025 die Förderung für fünf Exzellenzcluster. Die interdisziplinären Forschungsprojekte werden zunächst für sieben Jahre ab 2026 gefördert. Eine Verlängerung der Förderung um weitere sieben Jahre ist auf der Grundlage eines Fortsetzungsantrags möglich.